基因组算法立功!发现膀胱癌新靶点

膀胱癌是美国第六常见的癌症,根据美国癌症学会(ACS)的统计,2017 年美国约有 79000 人被诊断为膀胱癌,将近 17000 人死于这种疾病。在过去几年中,逐渐形成了根据基因表达模式对膀胱癌进行分类的趋势。已知一种称为 p53 样膀胱癌(p53-like bladder cancer)的基因表达模式与侵袭性的肌肉浸润性疾病相关,但人们尚不清楚该亚型对患者预后有何影响。现在,纽约西奈山卫生系统(Mount Sinai Health System in New York)的研究者通过算法模型,确定了两种生物标志物,它们有可能帮助肿瘤学家预测 p53 样膀胱癌患者的预后,并对其进行针对性治疗。相关论文发表在近期的《Oncogene》上。

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▲图片来源 123RF

据 ACS 统计,肌肉浸润性膀胱癌的 5 年生存率最高为 63%。患者对常规治疗(如化疗)的反应可能差异很大,因此需要有新的疗法来治疗这种疾病。近年来,使用免疫检查点抑制剂的免疫疗法成为膀胱癌治疗的重大进展,但是一些患者变得耐药。去年,罗氏(Roche)发现一种名为 TGF-β的蛋白质与患者对 PD-L1 抑制剂 Tecentriq 的反应相关,如果将 Tecentriq 与抗 TGF-β化合物联用,可以提高其有效性。

这次来自西奈山团队的研究确定了两种基于 microRNA 活性的 p53 样膀胱癌生物标志物。p53 样膀胱癌的命名来自与其相关的活性基因特征。它通常特别具有侵略性,并且对标准化疗耐药,但个体预后可能会有很大差异。microRNA 则是一种调节基因表达的遗传物质。研究者利用他们之前开发的计算模型“ActMiR”开展研究,它能根据基因表达的变化确定 microRNA 的活性。研究者用 ActMiR 分析了癌症基因组图谱(Cancer Genomic Atlas)中的膀胱癌数据,从中发现了两种 microRNA,它们在 p53 样膀胱癌中有抑癌的作用,其中一种与患者更好的存活率相关。在用 ActMiR 分析膀胱癌数据之前,西奈山团队已经用多种类型乳腺癌的数据作过验证。

虽然现在还处于早期阶段,西奈山的研究者相信这个研究结果暗示了靶向 microRNA 有潜力成为膀胱癌新疗法。其他研究者也在探索调控 microRNA 这个策略,比如伦敦帝国理工学院(Imperial College London)的研究者就在研究可以控制乳腺癌和肺癌的细胞迁移和生长的 microRNA。

西奈山的研究者表示还需要做更多的研究,来确定这次发现的两种生物标志物对于 p53 样膀胱癌患者个体化治疗的意义。“我们的算法不仅让我们深入了解了这种难以捉摸的膀胱癌的潜在细胞机制,而且还揭示了 microRNA 作为治疗靶点的潜力,”西奈山遗传和基因组学教授朱军博士评论说。

参考资料

[1] One step closer to personalized treatments for bladder cancer

[2] Discovery of New Biomarker Could Provide Personalized Treatment Options for Bladder Cancer

本文转载自:药明康德